Διάσπαρτες στην περιοχή βρίσκονται εκπληκτικές βυζαντινές εκκλησίες υπογραμμίζοντας το φιλόθρησκο χαρακτήρα των κατοίκων. Στο κέντρο της πόλης δεσπόζει ο μητροπολιτικός ναός του Αγ. Ιωάννη του Προδρόμου. Ο ναός χτίστηκε το 1852 από τον Ιταλό αρχιτέκτονα Ιάκωβο Σεβαστίνο. Μέσα στο ναό υπάρχει εικόνα του Ιωάννη του Προδρόμου, έργο του 1646. Η εικόνα είχε μεταφερθεί για ένα διάστημα στις Σπέτσες και λέγεται ότι έσωσε το νησί από τουρκική εισβολή. Ο μικρός ναός της Αγίας Τριάδας του 12ου αιώνα, με τις εξαιρετικά καλοδιατηρημένες αγιογραφίες, βρίσκεται ανάμεσα στο Κρανίδι και την Ερμιόνη, στην περιοχή Πικροδάφνη και αποτελεί σημαντικό βυζαντινό μνημείο. Για το χτίσιμο του ναού έχουν χρησιμοποιηθεί αρχαίοι κίονες και μάρμαρα που σε μερικά σημεία είναι ακόμα και σήμερα εμφανή. Ένας σημαντικός ναός ακόμα είναι του Αγ. Γεωργίου με ωραίες εικόνες από τον 17ο αι. Στο πευκόφυτο και ειδυλλιακό δάσος της Αγίας ΄Αννας, βρίσκεται το ομώνυμο μοναστήρι με πανοραμική θέα, ενώ σε κοντινή απόσταση στο Αρτίκι, βρίσκεται η εκκλησία του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου. Ανάμεσα στο Κρανίδι και το Πορτοχέλι βρίσκεται μια από τις νεώτερες γυναικείες μονές, η Παναγία Παντανάσσης. Ιδρύθηκε μόλις το 1965 με εντυπωσιακές τοιχογραφίες βυζαντινής τεχνοτροπίας και ανήκει στη μητρόπολη Ύδρας. Τέλος γραφικότατο θεωρείται και το ξωκκλήσι του Προφήτη Ελισαίου, στον περιφερειακό δρόμο.